O Conselho Científico é um órgão interno com competências genéricas de acompanhamento e orientação das atividades de carácter científico e técnico.
As funções que lhe estão atribuídas incluem:
- Emitir pareceres sobre os projetos de investigação, o orçamento, o plano e o relatório anual de atividades do INESC TEC
- Apoiar o Conselho de Administração nas matérias de desenvolvimento científico da instituição
- Implementar procedimentos de estímulo à excelência, avaliação de qualidade e promoção da imagem externa da atividade científica
O Conselho Científico é composto por representantes dos investigadores doutorados, a sua organização resultando diretamente da estruturação da atividade pelas áreas correspondentes aos Centros. Assim, cada Centro tem a sua Comissão Científica de Área, constituída por todos os doutorados. O Conselho Científico do INESC TEC, por sua vez, é constituído por um representante de cada Área e três membros designados pelo Conselho de Administração do INESC TEC, um dos quais preside.
Os seus membros são eleitos pelo Conselho Geral, para um mandato de cinco anos, sendo permitida a reeleição por uma ou mais vezes. O atual Conselho encontra-se designado para o quinquénio 2019/2023.