Agricultura de precisão, bioinformática, Biologia de sistemas, Modelos de Escala Genómica, mapas metabólicos
[Fechado]
Descrição da Oportunidade
- Rever o estado da arte, desenvolver benchmark e desenvolver a prova de conceito sobre modelos avançados de agricultura de precisão baseados na integração de dados espectrais, multiomicas e biologia de sistemas (SB). - Caracterizar respostas fisiológicas, metabólicas e transcricionais de videiras em estufa/campo em resposta a stress abióticos para validar dados espectrais de campo. - Desenvolver uma abordagem de BS para mapear as vias metabólicas da videira e inferir o seu fenótipo/estado fisiológico; - Explorar métodos computacionais e modelos metabólicos em escala genómica para otimizar o espaço fenotípico/funcional através de diagnósticos mecanísticos e simulações. - Desenvolver uma plataforma baseada em inteligência artificial que integre BS e dados espectrais em tempo real para promover a viticultura de precisão avançada. - Participar nas atividades laboratoriais e de campo (horário flexível) a decorrer no âmbito do projeto. - Teste e validação das soluções desenhadas em contexto real, e publicação dos resultados. - Pretende-se ainda que o investigador participe nas seguintes atividades: co/supervisionar estudantes PhD e MSc; desenvolver e escrever artigos científicos (percentil Q1); contribuir ativamente com os seus desenvolvimentos para concursos competitivos de projetos na linha de investigação. - Review state of the art, develop benchmarks, and create a proof of concept for advanced precision agriculture models based on integrating spectral data, multi-omics, and systems biology (SB). - Characterize grapevine physiological, metabolic, and transcriptional responses to abiotic stress, validating field/greenhouse spectral data. - Develop a SB approach to map metabolic pathways of the grapevine and infer a virtual grapevine phenotype/physiological feature space model. - Explore computational methods and genome-scale metabolic models to apply to optimize phenotype/physiological space through mechanistic diagnosis and simulations - Develop an AI-driven platform that fuses SB and real-time field spectral data to advance precision viticulture. - Participate in laboratory and field activities (flexible schedule) within the project scope. - Test and validate the designed solutions in a real-world context and publish the results. - The researcher is also expected to participate in the following activities: co/supervise PhD and MSc students; develop and write scientific articles (Q1 percentile); actively contribute their developments to competitive project contests in the research line.
Habilitações Académicas
Doutoramento em Ciências Agrárias, Bioengenharia, BioInformatica/BS, Engª Bitecnologica e áreas afins.
Requisitos Mínimos
-Agricultura de precisão e digital.- BS: ‘genome scale metabolic models’, ‘graph analysis’, ‘flux balance analysis’- Modelos preditivos baseados em AI.- Computacionais: R(Bioconductor), MATLAB (Biologia computacional), Python (ex. pyCOBRA, pyMEW) e Bioiformatica para pesquisa em bases de dados.- Integração multiomica (ex. HPLC, GCMS)).- Agricultura de precisão.
Fatores de Preferência
Experiência comprovada em Biologia de Sistemas e Bioinformática. O júri poderá não atribuir a bolsa se a qualidade dos candidatos for inferior à pretendida.
Período de candidatura
Desde 15 May 2025 a 28 May 2025
[Fechado]
Centro
Robótica Industrial e Sistemas Inteligentes