Conselho de Centros é um órgão não estatutário, composto pelos membros do Conselho de Administração, os Coordenadores dos Centros de I&D e os Responsáveis dos Serviços, que reúne quinzenalmente e que ganhou relevo ao longo do tempo.
É nas reuniões de CCI, caracterizadas pela sua informalidade e pela discussão aberta de todos os assuntos, que são discutidas e preparadas as decisões do Conselho de Administração sobre algumas questões vitais para o funcionamento do INESC TEC.